徳島城の本丸は標高61ｍの城山山頂にありました。
天守は東二の丸に築かれていたため、この本丸には詰所（番所）や櫓などが設けられていました。
残念ながら現在はなにも残っていませんが、その広さは実感できます。
現地に設置されている案内板の内容を紹介します。
本丸跡
徳島城の山城部分には、本丸・東ニの丸・西二の丸・西三の丸が置かれていました。
本丸は標高約61mの城山頂上に置かれた曲輪（くるわ）で、山城部分のなかでは最も面積が広く重要でした。本丸には、中央に置かれた御座敷と城山の管理人であった御城山定番（じょうばん）の詰めた御留守番所のほか、弓櫓（やぐら）や東西の馬具櫓、武具櫓、火縄櫓が設けられていました。櫓は戦いの際には防御施設となりますが、普段は武器を収めていました・藩主は城山麓の御殿で暮らし、城山に登ることは稀でしたが、この御座敷にも藩主専用の部屋があり、台所も設けられていました。また本丸東部に置かれた鐘は城下町の火事の際に打ち鳴らされ、町人たちの危急を救いました。
本丸の出入り口は東西の門が使われましたが、北口には御座敷の建物で隠された非常時の脱出口（「埋門（うずめもん）」）があり、大名の非常時に対する備えがうかがえます。
東二の丸には三層の天守が設けられていました。一般的に、天守は城郭の最上部に建てられましたが、徳島城では本丸から一段下がった同地に置かれていました。天守の一階は7間（約14m）四方と大きかったのですが、天守台はありませんでした。
西二の丸には鉄砲櫓と帳（とばり）櫓、その西方の西三の丸には材木櫓と平櫓が設けられていました。
西三の丸の跡地には、現在水道水配水池が設置されています。
