本多正信の弟の正重から出た家系。
下総国舟戸藩1万石に始まるが、正重の死去の際に2千石を減封されて廃藩、一時は旗本に降格された。
しかし、4代・正永のときに寺社奉行となり加増を受け、再び舟戸藩を立てて譜代大名に返り咲く。その後、上野国沼田藩2万石に転封、さらに6代・正矩のときに駿河国田中藩4万石へと転封された。
12代・正訥は幕末期、昌平坂学問所の初代奉行を務めた人物である。この正訥のときに田中藩が駿府藩に編入され、安房国長尾藩4万石を立ててそこに移った。正訥は版籍奉還を経て、長尾藩知事になっている。